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三代全长扩增子测序

基于PacBio长读长测序平台,能够轻松跨越微生物的16S rRNA基因/ITS等全长序列,提高物种鉴定的分辨率和物种注释的准确性,为微生物组研究提供更精准、更全面的信息。

测序平台与策略

PacBio SMRT测序平台CCS模式测序

技术路线

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生物信息分析流程及部分结果展示

 

                                        种水平物种丰度聚类图                                                    种水平差异物种Boxplot结果展示

 

                                                PCoA分析                                                   疾病诊断模型构建


应用领域

三代全长扩增子测序能提供更丰富的注释信息、更精确的物种鉴定和更真实的群落结构,可实现种以及种以下水平分类单元的研究。产品适用于以下领域:

1. 医学领域:疾病与人体微生物间关系,如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等;

2. 畜牧领域:肠道、瘤胃等微生物群落与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系;

3. 农业领域:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;

4. 环境领域:某一特定环境(雾霾、沙尘等污染环境,住宅、商场等生活环境)的微生物群落组成,有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋环境等微生物群落分布、基因功能及代谢网络等;

5. 特殊极端环境:极端环境条件下的微生物类群研究。